ИСУБД «Новая Афина» содержит:

Общесистемные модули составляют технологическое ядро ИСУБД «Новая Афина». Их наличие в банке является обязательным для нормального функционирования всех прикладных подсистем.

Прикладные подсистемы выполняют конкрентные бизнес-функции, соответственно направлениям деятельности банка. Они работают на основе единого финансового ядра, которое обеспечивает функциональную целостность системы: документооборот, машина проводок, подсистема «Расчетное обслуживание».

Прикладные подсистемы ИСУБД «Новая Афина» позволяют автоматизировать разнообразные направления деятельности банка, такие как: расчетно-кассовое обслуживание, рекламационная переписка (investigation), работа с корреспондентскими счетами, кредиты, депозиты, фондовые операции, депозитарный учет, факторинг, сейфовые ячейки, центры финансового учета, документарные операции, гарантии, аккредитивы, счета-фактуры, векселя, валютный дилинг, платежные карты физических  и юридических лиц, учет основных средств, нематериальных активов и материалов  и многие другие.

Дополнительные функциональности ИСУБД «Новая Афина» являются расширением функциональных возможностей прикладных подсистем. В состав системы входят также и функциональности общего назначения.